Saubusse a été un port depuis le moyen âge, pour la pêche, mais aussi pour le transport des produits forestiers, notamment des goudrons à destination de Bayonne, permettant ainsi au port de Bayonne de devenir un des ports exportateurs des plus importants aux 18ème, 19ème et 20ème.
La source de la Rouillère alimentant les thermes est connue depuis l'antiquité. Même usage que ceux de Dax ou Préchacq les bains.
L'église Saint-Jean Baptiste, classée au Monuments Historiques, aurait été occupée par les Chevaliers de l'Ordre de Malte.